Jetzt kenn ich mich nicht mit Kleinhunden aus, aber wenn sie das Adultfutter besser verträgt, würde ich das erstmal füttern. Was nützt ein Juniorfutter, wenn es nicht richtig verdaut als Durchfall wieder raus kommt?
Ansonsten wie die anderen bereits geschrieben haben, eine Sammelprobe machen und auf Parasiten untersuchen lassen und gegebenenfalls eine Ausschlussdiät machen.