Ist tierärztlich alles duchgecheckt? Ein gesunder erwachsener Hund sollte 2 Std durchhalten können, mal gar nicht zu reden von 30 Minuten.
Falls diesbezüglich alles in Ordnung ist, ein paar Überlegungen zur Ursachenforschung:
- Kann euer Hund stressfrei alleine bleiben?
Stress und Unruhe drücken auf die Blase.
- Stubenreinheit vom Hund aus gesehen bedeutet, man löst sich nicht da wo man bevorzugt ruht und frisst.
Das kann umgekehrt bedeuten, daß der Hund keine Hemmungen hat, sich in weiter entfernten, seltener benutzten Zimmern zu lösen. Der Hund einer Freundin pflegte dafür zB schon mal in den Keller zu gehen - war ihm weit genug weg vom Familienlager. 
- Gute Züchter achten darauf, den Welpen schon möglichst frühzeitig den Unterschied von draußen und drinnen - Naturboden versus Wohnung - zu zeigen und ihnen den Zugang ins Freie zu ermöglichen. So werden die Kleinen darauf geprägt, sich draußen zu lösen.
Nicht wenige Vermehrer kleiner Rassen ziehen aber ihre Welpen in der Wohnung auf, so daß sie Gras und Erde womöglich erst beim Welpenkäufer kennenlernen. Bis dahin haben sie sich aber daran gewöhnt, sich in Innenräumen zu lösen, und das ist mitunter sehr schwer zu durchbrechen.
Wenn der Besitzer dann im Bedarfsfall nicht sofort zum Gassigehen zur Verfügung steht, hat ein solcher Hund wenig Hemmungen, sich auch drinnen zu lösen.
- Bei Rüden muß man auch immer an Markierverhalten denken, besonders in fremden Wohnungen.
Was du beschreibst, klingt eher weniger nach Markieren, sondern eher nach anderen Ursachen. Markieren hebt aber allgemein das Selbstwertgefühl eines (unsicheren) Rüden, also ganz ausschließen möchte ich das nicht.