Ich nehme an, damit ist gemeint, den Kot eines gesunden Hundes in den kranken Hund einzubringen.
Hi, hier hatten wir bis vor kurzen 2 Hunde mit wiederkehrenden Giardien und Unverträglichkeiten.
Den einen, meine Leonbergerhündin, mussten wir leider im Dezember aus anderen Gründen gehen lassen, der Kleine wird nach wie vor bekocht.
Unsere TÄ hatte beide Hunde mit Bioresonanz ausgetestet. Der Kleine kam schon mit Durchfall (Giardien natürlich) und Erbrechen vor 3 Jahren zu uns, wurde dann getestet und hatte Unverträglichkeiten auf Rind ganz besonders und Lamm sowie Lachs (Öl!). Getreide, das Gluten enthält, verursacht schlimmen blutigen Durchfall. Pferd, Pute und Hähnchen sowie Fisch geht, Fisch frisst er aber ungern. Reis, Hirse, Quinoa geht. Er wird nach Plan von der TÄ bekocht.
Die Große, meine Leohündin, hatte nach jahrelangem Barf nach einer Impfung auf so ziemlich alles Unverträglichkeiten, besonders auf Huhn, Ente, Rind, Lachs, Lamm. Als einziges ging Pute und ab und zu etwas Pferd, aber nicht zu viel, sowie weißer Fisch wie Herring und Kabeljau. KH wurden in Form von Süßkartoffeln und Pastinaken gefüttert, Kartoffeln und Möhren ging nicht, sie hat auch keinerlei Getreide vertragen hat, besonders keinen Reis, ganz schlimm. Leider auch keine glutenfreie Sorten, wie Hirse oder Quinoa. Innereien ging nur Putenherz und Pferdeherz in kleinen Portionen,
Sie hat daher gekocht ca. 300g - 400g Fleisch bekommen, 200g Gemüse wie Zucchini, Stangensellerie, Kohlrabi, Kürbis, Feldsalat, und ca. 300- 400g Süßkartoffeln/Pastinaken. Plus Vitaminmix und Hanföl oder Kokosöl. Alles auf 50 Kilo Hund gerechnet natürlich 
Im Grunde hast du ja schon die Kartoffeln durch die Süßkartoffeln ersetzt, wenn ich das richtig verstanden habe, du könntest probehalber die Möhren noch durch Pastinaken ersetzen und gucken, was passiert.
Huhn haben wir dann ja durch Pute ersetzt, und zur Zahnpflege und für den Calciumhaushalt gab es zwei mal pro Woche rohen Putenhals. Ganze Makrelen wurden auch gern genommen. Leckerli habe ich mir welche aus 100% Pute geholt, die gingen ganz gut. Ich hole mein Fleisch in einer Barferie, und dort gab es auch die Putenleckerli.
Man kann auch Putenherzen ganz klein schneiden und anbraten und dann als Leckerli zum Training verfüttern.
Darmaufbau haben wir mit Symbiopet gemacht, auch Flohsamenschalen mit heißem Wasser übergossen und das entstandene Gelee dazu sowie Heilerde ab und zu hat gut getan. Von PerNaturam gibt es einige Darmaufbaumittel, zb das Enterogan, das haben wir auch gern verwendet kurweise. Unsere TÄ hat uns zum Beruhigen des Darms, wenn es wieder mal akut war, Activomin mitgegeben, das enthält Huminsäuren und soll den Darm schützen und eine gute Verdauung fördern.
Es gibt einen Thread rund um Darmgeschichten: Giardien & Co... der Darmgesundheits- Laberthread vielleicht findest du dort noch weitere Tipps für den Darmaufbau.
Ein Blutbild würde ich auch noch machen lassen, und ein Kotprofil. Dann weiß man woran man ist und ob man noch wo anders was drehen kann.
Gute Besserung! 
Edit: https://de.m.wikipedia.org/wiki/Stuhltransplantation