Erstmal ist Knurren unter Hunden ja nix Schlimmes, sondern lediglich Kommunikation. Das hat nicht sofort was mit Agression und Unvertäglichkeit zu tun.
Zweitens wird dein Hund nun ganz langsam reifer und erwachsene Hunde selektieren eben stärker, was Artgenossen betrifft. Ich würde gerade bei einem intakten Rüden nicht davon ausgehen, dass er zeitlebens mit jedem andern Hund super auskommt. Aber zwischen selektiver werden und kompletter Unverträglichkeit liegen ja auh nochmal Welten.
Ich habe einen 5jährigen intakten Chi-Rüden. An der Leine weiche ich anderen Rüden eher aus, da es in dieser Situation ansonsten schnell zu Rüdengeprolle kommt. Im Freilauf ist er prinzipiell gut verträglich, wenn wir da aber einem intakten jüngeren Rüden treffen, kommt es auch mal zu etwas Geproll bzw mein Rüde macht eine Ansage.
Bei einem Hund der wie der Welpe deines Vaters zur Familie gehört wird nach langsamer Gewöhnung wahrscheinlich eine einigermassen friedliche Koexiatenz möglich sein, da die Hunde einander ja vermutlich auch regelmäßig sehen werden. Ich würde aber auch davon ausgehen dass dein Havaneser den Welpen erstmal eher nervig findet.