Ich würde beim TA anrufen, und fragen, wie ich mich verhalten soll. Vielleicht wäre es auch sinnvoll, eine Art Tagebuch (Nahrung, Stuhlgang, Medikamentengabe..) zu schreiben. Damit du die Zusammenhänge besser nachvollziehen kannst.
Ich könnte mir vorstellen, dass durch die erhöhte Thyroxinzufuhr der allgemeine Stoffwechsel angekurbelt wird und die Verdauung auch beschleunigt wird. Dadurch, dass Trockenfutter so ne lange Verdauungszeit hat, konnte der Körper das Trockenfutter eben nicht genügend verdaulich machen -> Durchfall.
Ich würde also versuchen etwas zu füttern, das leicht verdaulich ist. Etwas nahrhaftes, das der Hund auch mag. Z.B Reis mit gekochten Hühnchen und Möhre oder so, bis der Durchfall weg ist, dann langsam fettigereres dazu.
Klingt für mich auch auf den ersten Moment nach Überdosierung. Es gibt doch auch Patienten, bei der Thyroxinspiegel stark schwankt, so kenne ich das jedenfalls bei Menschen.
Ist aber nur eine Vermutung bzw eine Idee.