Beiträge von pinkelpirscher

FarmCollie

Nein, Eigeninteresse. Und weils beim Cirneco gar nix gibt und beim Whippet auch nur wenig.

Ich nutze es insofern, als ich es anderen zur Verfügung stell und sollte es dereinst mit dem einen Hund tatsächlich einen Wurf geben, dann wohl angelehnt an die Ergebnisse oder gerade deshalb. (Momentan kennt man erst 2 verschiedene Haplotypen in der Rasse und die hat meine Hündin beide)

Leider ist bei uns aktuell weder ÖKV noch Windhundclub an einer Datenbank interessiert, weil zuwenig aktives Interesse von Züchterseite da.

Öffentlich sind sowohl bei MyDogDNA als auch Feragen nur die Daten, die von Nutzern auch aktiv freigegeben werden, dann durchaus auch mit vollem Namen, zumindest vom Hund.

Leider existiert das Breeder Tool bei MyDogDNA nimmer, da konnte man auch nach genetischer Passung sozusagen suchen. Embark hat sowas in der Art wohl mittlerweile auch und Feragen eben eine noch relativ kleine Datenbank, zumindest bei "meinen" Rassen, weil da nix an Tests vorgeschrieben ist, aber inkl

DLAs. Getestet sind großteils nur (Zucht)Hunde von engagierten Einzelpersonen.

Der deutsche Windhundverband hat mal eine Auswertung zur Diversität basierend auf den MyDogDNA Daten erstellt und Züchterkonditionen, für alle, die teilnehmen, ausgehandelt, und die Showgreyhoundleut sind da auch teils relativ aktiv, aber alles in allem ist insbesondere Haplotypenbestimmung noch Randerscheinung (und die Daten, die man bisher hat, sind eher ernüchternd. Viel ist bei einigen Rassen nimmer da).

Zitat von just2dun

Bei My Dog DNA war mal jeder Punkt ein getesteter Hund. So gesehen sind grad mal 14? Hunde in der Datenbank. Je mehr getestet sind und damit mit in der Auswertung sind umso genauer wird es und vielleicht tauchen ja dann Hunde auf die die Lücke füllen. Und damit sind es keine 2 unterschiedlichen Wolken sondern halt 1 Wolke mit unterschiedlichen Zentren.

Ebenfalls bei MyDogDNA konnte man unterschiedliche Rassen einspielen. Und dann war eben direkt ersichtlich das sich der IFH essentiell vom DSH oder den Malamuten unterschied....

Ja. Es waren bei MyDogDNA zwsr mehr, aber auch sehr wenige, gibt eine Auswertung des DWRZV dazu - letztlich ist der Whippet auch aufgespalten. Rennlinie hat quasi keinen Bezug zu Show und S&L ist manchmal dazwischen, aber trotzdem tendentiell weiter weg von Rennern. Die 14 öffentlich zugänglichen Hunde stammen klar aus den 3 Linien.

Ich müsst nochmal suchen. Rennlinie ging bei MyDogDNA bis in den 45% Heterozygotiebereich, also Mischling (was nicht wundert) während Show sich unter 30%, eher Richtung 25% bewegte. Wobei die Diversitätswerte beider Labore sich etwas unterscheiden. Feragen testet 10x mehr Marker, als es MyDogDNA tat.

Zitat von just2dun

Die 1,5 IZK sind ja die errechneten. Aber die gehen ja nur über 4? Generationen.

Die 6% IZK beziehen sich auf was?

Und die 37% Heterozygothie?

Ups, Du hast recht, ohne Generationen is es nicht vergleichbar.

Papierwert ist 7 Generationen, genomisch 6 Generationen.

6 Generationen sind am Papier 0,67%, der genomische COI ist aber 6%

Nein, die Heterozygotie ist die genetische Diversität, also wieviele unterschiedliche Marker vererbt wurden.

Wenn's wen interessiert .

Anhand einer meiner Hündinnen.

Da sieht man auf der ersten Grafik wo im Rassespektrum sie daheim ist (und dass die 3 existierenden Rassen eher 2 - 2,5 Rassen sind) im Gegensatz zu einem hypotetischen Partner mit passender Immungenkombination.

Die Diversität der Rasse ist hier noch künstlich hoch, sehr wenige Hunde getestet und wie man von MyDogDNA Ergebnissen rückschließen kann, hauen die Hunde rechts den Schnitt hoch, während links eigentlich die größere Population daheim ist, die wahrscheinlich deutlich drunter liegt.

Genomischer Inzuchtswert liegt bei 6% (der Rassedurchschnitt kann auch künstlich niedrig sein, weil Schnitt der bisher getesteten Hunde).

Laut Papier läge ihr Wert bei 1,50%.

Wenn man dann noch bedenkt, dass sehr wahrscheinlich vor 4 Generationen an sehr wahrscheinlich nicht nur 1er Stelle eingekreuzt wurde (also 1,5% sowieso nicht stimmen, man würde weniger erwarten), dann sind die 6% eher erschreckend in meinen Augen.

Haplotypen fallen so aus, dass die bisher gefundenen gängigsten Varianten vorkommen, einmal doppelt. Bezug zu klassischer Whippet-Autoimmunerkrankung sehr wahrscheinlich.

Heißt nicht, dass Hund krank ist, oder wird, es aber für die Population sinnvoller wär, mit ähnlich DLA ausgestattetem Hund zu verpaaren.

Und für die allgemeine Varianz in der Rasse, müsst man idealerweise auch so verpaaren, dass die nächste Generation irgendwo zwischen den Clustern liegt.

Wird aber nicht gemacht.

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FarmCollie

Es wird auch noch sehr wenig mit dem genomischen Inzuchtskoeffizenten gearbeitet. Dabei unterscheidet sich der teils exklatant vom Papierwert.

Da ist es, zumindest im deutschsprachigen Raum auch Feragen, die da am Meisten machen und anhand der Daten auch Rassediagramme und Cluster erstellen, die recht nützlich sein könnten.

MyDogDNA/Genoscooper hatte sowas ansatzweise, bevor es Wisdom wurde.

Zitat von FarmCollie

Zitat von pinkelpirscher

[...] der den selteneren oder vielfältigeren DLA-Haplotypensatz, der besser zum Rüden passt etc.

Ich bin begeistert! Ich komme als Genetiker aus der HLA-Welt und frag mich schon länger, ob das bei Hunden /seltenen Rassen eingesetzt wird. Wäe für kleine Populationen so sinnvoll! Weißt du das für Deutschland? Aus Skandinavien habe ich da Mal was gehört...

Im "größeren" Stil macht das derzeit hauptsächlich Feragen, also voll aufgeschlüsselt. Embark hat keine DLA II dabei (oder sagt nur: homo- oder heterozygot, da müsst ich nochmal nachschauen).

Großteils lassen eher private Initiativen testen. Einige wenige Rassevereine versuchen sich in der Kartografierung ihrer Rasse quasi, aber verbreitet ist es noch nicht.

Leider auch aus Unverständnis, warum und weshalb, denk ich.

Ich hab ja u.a. eine relativ seltene Rasse und da den weltweit ersten getesteten Hund. Naja, mittlerweile hamma 4 Hunde getestet. Und sehr viel Scheu davor erlebt.

l'eau

Aber es ist nicht gesagt, dass der große Bruder automatisch groß vererbt. Kann auch sein, dass der kleinere Nachkommen zeugt, als der kleinere Bruder. (Gilt alles auch umgekehrt für die Hündin. Kann ja auch sie der Part sein, der die Größe vererbt)

Über Querpedigrees und Nachzuchtkontrolle kann man eventuell was ableiten, aber letztlich sieht man manches nur, wenn man es probiert.

Zitat von StinaEinzelstueck

Zitat von FarmCollie

Wie meinst du das?

Wenn aus einem Wurf zwei Hündinnen in die Zucht gehen (natürlich mit der Ausgangslage, sie erfüllen beide die nötigen Bedingungen - Hüfte, Augen, …) und gedeckt werden sollen, dann dürften diese beiden Hündinnen - bei Überprüfung des Inzuchtkoeffizienten - mit genau denselben Rüden gedeckt werden … sie haben ja einen völlig identischen Stammbaum) - so habe ich es bisher verstanden?

Ja. Nur vererben sie unterschiedlich. Sind ja keine Klone.

Kann zb eine die bessere, weil größere, genetische Diversität haben oder den selteneren oder vielfältigeren DLA-Haplotypensatz, der besser zum Rüden passt etc.

Trockenfutter-Leberkäsesemmel-Milchbrötchen-Karotte mit Joghurt

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Nachmittagsjause: grüner Pansen

Whatsoever

Is nur völliger Unsinn, was da steht.