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Bei einer exokrinen Pankreasinsuffizienz (EPI) kommt es infolge einer Zerstörung bzw. Atrophie (Schwund) der sekretproduzierenden Zellen zu einer mehr oder weniger eingeschränkten Verdauungsenzymproduktion und somit zu einer reduzierten Abgabemenge in den Dünndarm.
Dieser Mangel an Enzymen führt zu einer mangelhaften Verdauung, wobei anfangs in der Regel vornehmlich Fettverdauungsstörungen auftreten. Die ungenügende Fettverdauung führt dazu, dass ein zu hoher Anteil an unverdauten Fetten die Mikroflora des Dickdarms überschwemmt und diese in ihrer Nährstoffaufnahme von Vitaminen, Elektrolyten und Spurenelementen behindert.
Mit fortschreitender Erkankung werden auch die mikrobiellen Verdauungsvorgänge von Kohlenhydraten und Eiweissen im Dickdarm blockiert und ein Abmagerungsprozess setzt ein.