Was ich auf keinen Fall machen würde, ist Trocken- und Nassfutter mischen, das kann, da können Gärungen entstehen, die den Magen angreifen. Allzu oft würde ich das Futter nicht wechseln. Hast Du es vlt. schon einmal mit selber kochen versucht, damit geht es Trixie auf jeden Fall besser.
Eine Allergie muss glaube ich nicht immer mit Durchfall einhergehen, aber wenn ansonsten keine Symptome vorhanden sind wie Juckreiz oder entzündete Augen/Ohren würde ich nicht an eine Allergie denken.
Ich würde aufgrund der Beschreibung eher an eine Darm- und/oder Pankreasentzündung denken. Diese sind, wenn sie chronisch sind, nicht so einfach nachzuweisen (hatte ich meine ich schon in einem anderen Thread geschrieben). Trixie hat beides und erst die 3te TÄ hat die Diagnose mittels Ausschlussverfahren gestellt. Von einer Biopsie hatte unsere TÄ abgeraten, weil es sein kann, dass Teile, die nicht betroffen sind, entnommen werden und dann ist man nachher auch nicht schlauer.