Ich glaube nicht, dass das bei euch ein typisches Welpenproblem ist. Da scheint was anderes dahinter zu stecken. Was, kann man natürlich hier nicht beurteilen.
Pinkelt sie generell immer nur auf den Teppich? Dann wäre meine erste Handhabe diesen wegzuräumen. Sollte sich damit das Problem geben, kannste den Teppich ja später (nach gründlicher Reinigung) mal wieder hinlegen.