Hallöchen!
Also ich kann dir ja sagen wie es bei uns geklappt hat - ohne jetzt ein bestimmtes System angewendet zu haben oder dass ich da ein Profi bin! 
Unser Kleiner lag damals auch auf seiner Decke direkt neben unserem Bett und damit er nicht ungestört aufstehen und in irgendeine Ecke wandern kann, haben wir seine Decke mit so ganz dünnen Brettern begrenzt. Denn in sein Bett wird er sicher nicht freiwillig machen, bei uns hat's dann ziemlich gut geklappt, weil er dann gequiekt hat. Ich persönlich mag das in solche Kisten nicht so sehr. Wenn man es natürlich von Anfang an auch tagsüber als seinen "Stammplatz" hat ist es natürlich okay. Aber da du ja geschrieben hast, dass er auch schon SEINE Decke hat, würde ich ihn auch auf SEINER Decke lassen.
Joa also wie gesagt, hat bei uns geklappt, weil man einfach ein bißchen mehr Kontrolle über den Kleinen hat.
Viel Erfolg! 