Du solltest Dir in erster Linie die Frage stelle:
WIE SEHR möchtest Du diese Wohnung? Muss es genau DIE Wohnung sein?
Hat diese Wohnung irgendetwas, was andere nicht hätten (Garten,...)?
Wäre sie in der Erhaltung billiger? Findet man solche Wohnungen nur selten in Deiner Gegend?
Wenn keines dieser Dinge zutrifft, würde ich sie aufgrund der Nachbar-Problematik nicht nehmen.
Wenn genug Vorteile überwiegen würden, würde ich sie nehmen, den Nachbarn erstmal mitteilen, dass ab nun geübt wird mit dem Hund und Du zusiehst, dass der Hund rasch dort Alleinebleiben kann. Ich denke, wenn man von Beginn an gleich offen mit den Nachbarn darüber spricht (da ihr ja neu seid) wird ein gewisses Verständnis schon vorhanden sein.