Hund versucht mich zu unterwerfen

Guten Tag liebe Community,
Ich besitze einen 6 Jahre alten Schäferhund.
Größtenteils komme ich problemlos mit meinem Hund aus und bin vollkommen zufrieden mit ihm. Er ist ein lieber, verspielter und sehr verpeilter Rüde.
Leider ist er, wie ich selbst finde, ein eher schlecht erzogener Hund (bin mir der falschen Erziehung in jungen Jahren durchaus bewusst).
Wenn ich, zusammen mit ihm, Zeit im Garten verbringe dann spielt er sehr ausgelassen und vollkommen friedlich. Leider ignoriert er dabei häufig meine Kommandos gänzlich und kommt meist nur dann wenn es ihm gefällt.
Während ich mit ihm laufe, zieht er an der normalen Leine, da er von Wegrand zu Wegrand pendelt und ständig neue Dinge riecht oder sieht. Wenn ich zusammen mit ihm mit Schleppleine laufe, gibt es keinerlei Probleme. Er zieht nur sehr selten und kurz, folgt den Wegen auf Kommando und rennt nicht unkontrolliert herum. Hierbei vermute ich einfach, dass die normale Leine zu kurz ist.
Mein größeres Problem ist die Tatsache, dass er selbst nach einigen Stunden des Laufens nicht auf meinen Befehl in den Zwinger geht. Auf Kommando meiner Eltern hingegen gibt es keinerlei Probleme. Ich bereite ihm deshalb erst sein Futter zu und stelle seinen Napf in seinen Zwinger, dann ist auch das kein Problem mehr.
Allerdings kommt es dann zu Problemen wenn ich seinen Zwinger gereinigt habe und sein Wasser usw. aufgefüllt habe. Sobald er merkt, dass ich meine Aufgaben beendet habe, beginnt er damit mich anzuspringen und nach mir zu schnappen. Er beißt nicht und ich habe nie erlebt, dass er tatsächlich beißt aber er versucht dennoch zu schnappen. Häufig kann ich ihn auch recht schnell wieder beruhigen aber mich belastet diese Situation der Ungewissheit da ich meinen Hund doch sehr liebe aber ein solches Verhalten keinesfalls tolerieren kann und möchte.
Ich gebe ihm in oben beschriebener Situation klar zu verstehen, dass sein Verhalten nicht in Ordnung ist und wehre ihn ab aber ich möchte der Ursache dieses Verhaltens auf die Spur gehen.
Im Internet fand ich nun verschiedene Theorien. Einerseits deutet sein Verhalten darauf hin, dass er mich nicht als "Rudelführer" anerkennt aber andererseits fand ich auch die Theorie des fehlenden Vertrauens.
Die zweite Theorie erscheint mir jedoch sehr unglaubwürdig, da ich meinem Hund gegenüber immer versucht habe Sicherheit für ihn auszustrahlen und sich auch gezeigt hat, dass er mir vertraut.
Nun hoffe ich hier Hilfe finden zu können damit ich eben die beschriebenen Situationen zukünftig nicht mehr erlebe.

Wenn ich im Zwinger bleibe, beruhigt er sich für eine gewisse Zeit wieder aber beginnt nach einiger Zeit (ich vermute, er rechnet damit, dass ich nun bald gehe) erneut damit, mich anzuspringen.
Ans Haus ist der Hund nie gewöhnt wurden, da er und alle seine Vorgänger immer im Zwinger gehalten wurden.
Ich versuche den Hund, so häufig es mir möglich ist in alltägliche Situationen zu integrieren (Rasenmähen im Garten, Arbeiten im Wald usw.). Leider wird es dadurch erschwert, dass ich nicht weiß, wie ich den Hund dazu bewegen kann, an einem bestimmten Ort zu bleiben oder irgendwo im Wald zu verschwinden wenn er unangeleint herumläuft.
Ich kann mir allerdings nicht erklären wodurch dieser Stress für den Hund entsteht wenn ich ihn in seinem Zwinger zurücklasse. Er war es bereits als Welpe gewohnt, die Nacht oder die Zeit in der weder ich oder meine Eltern zuhause sind im Zwinger zu verbringen. Das bedeutet keinesfalls, dass der Hund im Zwinger völlig ausgeschlossen wäre. Der Zwinger befindet sich unterhalb einer Verbindung zwischen zwei Teilen des Hauses und liegt direkt am angrenzenden, leider uneingezäunten Bereich des Hofes wo der Hund eigentlich nur selten allein ist.
Weder Stress noch Bedrängnis kann ich mir plausibel erklären da er besagtes Verhalten erst seit einiger Zeit zeigt.
Wenn er zuvor, zum Beispiel im Garten während ich mit im gespielt habe kurz versucht hat zu schnappen hab ich immer versucht ihm deutlich zu zeigen, dass sein Verhalten nicht richtig war und diese Maßnahme schien immer sehr gut zu funktionieren.
Den Tipp bezüglich positiv aufbauen werde ich heute direkt testen.

Mir bekam bereits vor einiger Zeit der Gedanke den Hund tagsüber im Garten herumrennen zu lassen, auch während niemand zuhause ist aber ich habe die Befürchtung (aufgrund früherer Erfahrungen), dass er sich unter dem Zaun hindurch gräbt und dann niemand daheim ist um ihn einzufangen. Zudem liegt der Garten eher an der abgewandten Seite des Hauses wodurch der Hund eher von der Familie getrennt würde als mehr Zeit mit ihr zu verbringen.